وقال الحبوبي في بيان استقالته إن عارضا صحيا باغته يتطلب علاجا طويل الأمد خارج العراق أجبره على تقديم استقالته من المنصب إلى رئيس الوزراء، مشيرا إلى أنه كان يأمل أن يحقق حلمه وحلم العراقيين في رؤية بغداد الجميلة الغافية على ضفة نهر دجلة، وهي تستعيد ألقها، وتوفير الخدمات لسكانها بما يليق بهم.
وأضاف "يحزنني أن أضطر بعد فترة قصيرة من تسلمي المسؤولية إلى مغادرة بغداد؛ ولكني بعد التباحث مع رئيس الوزراء، وتبادل الأفكار كلي أمل ورجاء أن أمين بغداد الجديد سيكون على قدر ثقة الرئيس وثقة الأهالي، ويحمل من الصفات والمؤهلات ما يجعله أهلا لهذه المسؤولية الكبيرة.